超净工作台一般是采用紫外线灯灭菌，工作台内有紫外灯的。无菌室内的紫外灯开关接在无菌室的门外。先将工作台的操作门关好，再开工作台的紫外灯，走出门外的时候开无菌室的紫外灯开关。时间一般为30分钟。
超净工作台具体操作规程如下：
1．超净工作台操作使用前的准备工作
（1）开启超净工作台风机，净化台内环境。打开工作灯达到工作照度。
（2）检查超净工台中准备的各种灭菌饲养和实验物品是否齐全。若需更换笼盒。检查灭菌笼盒准备情况，并用不锈钢推车移至超净台移门边。
（3）检查喷雾器喷洒效果及超净台内外擦抹用的药液是否已配置好。
（4）打开房间内排风系统。排除打开笼盒时逸出的有味气体。
（5）检查IVC机组各种表头指针及目视各笼盒内的动物情况，估测IVC运行情况。
（6）记录影响实验动物繁殖、生长、发育的主要环境参数，如温度、相对湿度、日温差、笼盒内外压差等。
2．超净工作台操作使用程序及规范
（1）人员带好一次性口罩、帽子及医用乳胶手套。
（2）用双手轻轻抬起IVC笼盒外端，沿笼架搁挡向外移出笼盒，放在超净工作台旁的不锈钢小推车上。
（3）用药液喷雾器充分喷洒双手手套外表及IVC笼盒的外面，消毒灭菌并沾粘住表面的尘埃，防止进入超净台时被层流气体吹扬。也可用带手套的双手浸入药液容器中，捞起并拧干药液毛巾，擦干手套外液滴，同时擦一下笼盒的外表。
（4）打开超净工作台移门，把笼盒移入超净工作台。
（5）适当拉下超净工作台移门。打开IVC笼盒盖底之间的紧固扣并打开笼盖。侧卧放在一边。